Implantado em 1998, o curso de Engenharia Química da Unochapecó já formou 08 turmas, totalizando mais de 100 profissionais egressos.

Atualmente o curso é coordenado pelo professor Murilo Cesar Costelli, graduado em Engenharia Química pela Unochapecó, mestre em Engenharia Química pela UFSC e com doutorado em andamento na mesma instituição.

As aulas do curso de Engenharia Química são nos turnos vespertino e noturno. Anualmente são oferecidas 50 vagas e o ingresso dos alunos se dá no primeiro semestre letivo. O graduado neste curso recebe o título de Bacharel em Engenharia Química.